Les commerçants sont concernés très directement par les évolutions des cartes de paiement. Dans ce domaine, les règles européennes d’interopérabilité permettent de développer l’acceptation des cartes, tout en renforçant la concurrence entre systèmes de cartes.
Grâce aux règles européennes d’interopérabilité des cartes, les commerçants ont un choix plus large concernant la banque à laquelle ils confient l’acquisition de leurs transactions par carte. Ils bénéficient également des baisses de coûts résultant des économies d’échelle réalisées par les prestataires de traitement et de la standardisation des terminaux d’acceptation.
La généralisation dans tout l’espace SEPA des cartes à puce à la norme internationale EMV renforce la sécurité des paiements par carte en accroissant le nombre de paiements par carte qui nécessiteront le code confidentiel (code PIN). Les commerçants peuvent ainsi bénéficier de la même sécurité pour des paiements réalisés par des porteurs européens que par des porteurs français, ce qui devrait se traduire par une baisse globale du niveau de fraude.
Enfin, la mise en place des règles européennes d’interopérabilité des cartes rend possible une plus large utilisation des cartes par les porteurs.
En France, les cartes de paiement interbancaires « CB » permettent déjà pour la plupart d'effectuer des transactions transfrontalières et sont conformes aux normes techniques EMV. Le passage à SEPA pour les cartes de paiement n’implique donc pas de changement perceptible pour les porteurs et devrait être également transparent pour les commerçants.